<html>
  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    <font face="serif">Yesterday I finished going through all of the
      code sent to me for project 1.  My basic process of grading these
      was to build a series of nmr.in files that test your programs on a
      series of data files using different techniques and methods.  75%
      of the programs submitted to me did not run to completion on
      anything except the small dataset that I gave you.  According to
      my grading practices that would get you a maximum of a 50% for the
      code.<br>
      <br>
      Those codes that did run to completion on my test sets had some
      minor issues with the results.    I also know that some of you
      have made significant progress on Project 2 (even though there are
      issues with project 1).   Because I want everyone to do well, get
      credit for what you have done, and for this to be a good learning
      experience, here is how we are going to continue.<br>
      <br>
      1.  Project 2 is GOING AWAY as far as an independent grade<br>
      <br>
      2.  Project 1 can be resubmitted (code only, no papers) with the
      following stipulations:<br>
      <br>
      a.  Your program should be able to use the modified form of the
      nmr.in file found on the class website.  <br>
           It has one additional line of input, so you will have to
      modify your codes to handle this.  Please understand, I am<br>
           going to be using input files that look exactly like nmr.in
      (with the # comments).  If your program crashes<br>
           on reading this input then it does not work.  If you don't
      know how to read input files like this then please ask for <br>
           help and don't just assume that I am going to use input files
      formatted like you want to format them.<br>
      b.  Your program has to build/compile with ONE COMMAND and run
      with ONE COMMAND and produce the<br>
           output file specified in the correct format (in the examples
      this file was called analysis.txt)  I am not going<br>
           to accept programs where I have to run lots of different
      pieces of code with different parameter sets to try <br>
           and produce the desired output.<br>
      c.  Your program should be able to be run on ALL THREE different
      data files found on the class website with the<br>
           only change being that I change the name of the input file in
      nmr.in  Many of your codes crashed on the one <br>
           now labelled "for grading" that has the name compound1.dat  
      <br>
      d.  the due date for these resubmissions will be 11:59 PM  on the
      Friday of Finals week<br>
      <br>
      and...<br>
      <br>
      3.  Actually incorporating the DFT filter from PROJECT 2 in your
      resubmission will be EXTRA CREDIT.  There is no longer a <br>
           requirement for the one page paper.  Extra credit will be
      awarded based on how many ways you implement<br>
           the method to recover the filtered array:<br>
               a. Inverse Matrix Multiplication -- up to 25 points.<br>
               b. Inverse Matrix Multiplication and Direct Linear Solver
      -- up to 50 points<br>
               c.  Inverse Matrix Multiplication, Direct Linear Solver,
      and Jacobi Solver -- up to 100 points<br>
           If a submitted code crashes on input no credit will be
      received.  We will go over this in some detail on Thursday.<br>
       <br>
      <br>
      Let me know what questions you have.  <br>
    </font>
    <pre class="moz-signature" cols="72">-- 
Andrew J. Pounds, Ph.D.  (<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:pounds_aj@mercer.edu">pounds_aj@mercer.edu</a>)
Professor of Chemistry and Computer Science
Mercer University,  Macon, GA 31207   (478) 301-5627
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://faculty.mercer.edu/pounds_aj">http://faculty.mercer.edu/pounds_aj</a>
</pre>
  </body>
</html>